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Wellcome Sanger研究所序列参考基因组3,000年危险的细菌

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与太平洋生物科学(PacBio)合作,门罗公园,CalifWellcome Sanger研究所的研究人员,欣克斯顿英国已测序的基因组,000个细菌,包括一些世界上最危险的。收集的细菌类型文化的国家集合(场所)包括致命的霍乱菌株,痢疾,以及每年感染全世界数千万人的瘟疫。

通过解码的DNA这样的细菌,研究人员希望更好地了解它们引起的疾病以及它们如何对抗生素产生耐药性。基因组图谱,可以公开获得的,还可能导致开发新的诊断测试,治疗,或者疫苗。

Parkhill

朱利安•Parkhill博士,康康桑格研究所。

NCTC成立于1920年,,目前房屋超过5,500种细菌,使它最持久和世界上最大的收集的临床相关的细菌。它的广泛使用使研究人员能够比较历史和现代菌株推进全球流行病学的知识,毒力,预防,传染病的治疗。

抗生素耐药性是一个重要的全球问题,这些收集包括一些已知的最重要的耐药细菌。这些包括肺结核、全球十大死亡原因之一,单独感染1040万年和2016年造成170万人死亡;淋病,每年有7800万人感染了性传播疾病,现在变得非常难以治疗。1,二NCTC还含有耐甲氧西林的样品。金黄色葡萄球菌(MRSA),对多种抗生素耐药,可引起危及生命的感染在医院。这些菌株的基因研究将帮助研究人员了解抗生素耐药性的机制,并且寻找他们盔甲上的裂缝以便治疗。

还主动测序收集的所有类型菌株的细菌,这是用来描述和分类每个物种的第一个菌株。这些高价值的菌株的基因组序列基本开发方法来识别特定的感染人,包括在现场诊断细菌感染的试验,快速识别爆发的来源,并帮助控制感染。

收藏中许多具有历史意义的菌株包括16个由青霉素发现者亚历山大·弗莱明沉积的菌株,包括从他自己的鼻子取样的。同样值得注意的是第一个细菌沉积在国家反恐怖主义中心:dysentery-causing的应变福氏志贺菌1915年与一战战壕中的士兵隔离。

科拉克

乔纳斯·库尔拉赫,博士,太平洋生物科学。

“像NCTC这样的历史收藏品对于理解当前的病原体具有巨大的价值,“朱利安·帕克希尔说,博士,病原体基因组学威康基金会桑格研究所的负责人。“非常精确地了解在引入抗生素和疫苗之前和期间细菌的样子,并将它们与来自相同收集的当前菌株进行比较,向我们展示了他们如何回应这些治疗方法。这反过来又帮助我们开发新的抗生素和疫苗。PacBio的全面DNA测序使深层基因组分析成为可能,我们很高兴能和他们合作完成这个重要项目。”“

“通过SMRT测序实现的高质量基因组图谱允许对这些细菌进行前所未有的理解,“Jonas Korlach,博士,PacBio的首席执行官。“我们很高兴被像Wellcome Sanger这样的机构选中,帮助为科学界和公共卫生界创造如此重要的资源。”william hill公司官方网站“

“这种资源是公共卫生和测序细菌的重要工具,我们已经为迎接21世纪做好了收集NCTC的准备,以便研究界能够跟踪和理解细菌,“朱莉·拉塞尔说,文化收藏主管全国感染英国公共卫生服务。“这个集合,我们提供追踪感染的工具,并确定耐药细菌的爆发,改变英国的公共卫生。”“

向前走,NCTC收集的所有细菌种类将在收集后进行测序。研究人员可以从NCTC网站.关于每个菌株的完整信息,包括它们的DNA序列,可以通过欧洲生物信息研究所.

工具书类

1.肺结核(在线)。日内瓦:世界卫生组织,2018.可在:www.who.int/en/news-./.-sheets/./tuberc.is.7月7日访问2018.

2。耐药性淋病呈上升趋势,新药需要(在线)。日内瓦:世界卫生组织,2017。可在:www.who.int/en/news-././07-07-2017-抗生素耐药性淋病正在上升-需要新药.7月7日访问2018.

3.第一次世界大战的士兵帮助对抗痢疾[在线]。欣克斯顿英国:威康桑格研究所,2014。可在:www.sanger.ac.uk/news/view/2014-11-07-World-war-I-soldier-help-in-.-to-dysentery.7月7日访问2018.

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